生殖器疱疹主要是通过性接触沾染的,所以生殖器疱疹的沾染源就是患者及带病毒者,特别是在患者的生殖器皮肤或黏膜的疱疹内含有单纯疱疹病毒,可通过性接触而沾染给配偶或其他性伴,也可在同性恋者中相互沾染。在口腔或口腔周围得了疱疹的人,可通过口腔-生殖器性交,使对方感染生殖器疱疹。
由于有感染性的病毒能在湿润的环境中存活数小时,因此单纯疱疹也可通过污染物而间接传播。由于生殖器疱疹在潜伏中也有沾染性,所以会在不知不觉中成为疱疹的传播者和受害者。疱疹病毒在潜伏期时存在于脊髓的神经中,生理上其实不会有任何症状,但是此时病毒已具有沾染性了。而疱疹病毒发作后,会有刺痛、炽热感、皮肤溃烂等症状出现,在美国,平均有4分之1的人有性器官疱疹病毒潜伏在体内,其中只有5分之1的人知道自己已得了疱疹。不过由于在潜伏期是没有任何症状的,所以这些患者在不知道自己已感染了疱疹病毒的情况下,经过性接触时体液的交换将疱疹沾染给他人。对成人来讲,生殖器疱疹的危害不大,可是得了疱疹的孕妇却可能在分娩的进程中把病毒沾染给新生儿,而伤害新生儿的脑部,严童的还会夺走婴儿的生命。
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